Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms