Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP58Q9Y2X3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP58Q9Y2X3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms