Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD3Q9UJU5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms