Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.651e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 EME2-206ENST00000570069 5613 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 SCAF4-206ENST00000485790 1282 ntTSL 222.35■■□□□ 1.171e-23■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-23■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-23■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.181e-23■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-209ENST00000490717 560 ntTSL 426.79■■□□□ 1.885e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-211ENST00000498545 1118 ntTSL 1 (best)26.79■■□□□ 1.885e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-205ENST00000478165 578 ntTSL 326.79■■□□□ 1.885e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-207ENST00000483698 555 ntTSL 226.79■■□□□ 1.885e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-203ENST00000455432 555 ntTSL 424.37■■□□□ 1.495e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-208ENST00000490104 2717 ntTSL 220.9■□□□□ 0.945e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-206ENST00000481818 421 ntTSL 319.66■□□□□ 0.745e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-204ENST00000467324 2843 ntTSL 519.38■□□□□ 0.695e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 TSN-210ENST00000495112 605 ntTSL 413.89□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 23.1
GEMIN5Q8TEQ6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-7■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.211e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 423.91■■□□□ 1.422e-16■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 522.87■■□□□ 1.252e-16■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 521.64■■□□□ 1.052e-16■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-208ENST00000495756 1455 ntTSL 1 (best)30.21■■■□□ 2.433e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-205ENST00000488910 681 ntTSL 228.28■■■□□ 2.123e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.013e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-206ENST00000492886 639 ntTSL 323.28■■□□□ 1.323e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-209ENST00000496423 737 ntTSL 520.03■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 23
GEMIN5Q8TEQ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.322e-6■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 CDC34-203ENST00000586788 900 ntTSL 239.96■■■■□ 3.994e-8■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.974e-8■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-19■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 316.69■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.743e-8■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 FBXL19-206ENST00000562798 299 ntTSL 429.26■■■□□ 2.275e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 TOMM40-205ENST00000589649 731 ntTSL 240.21■■■■■ 4.037e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.027e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.027e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.527e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.087e-7■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 22.9
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.592e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-203ENST00000437202 1479 ntTSL 1 (best)36.57■■■■□ 3.442e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.592e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-204ENST00000462909 1294 ntTSL 327.04■■□□□ 1.922e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-210ENST00000484881 740 ntTSL 525.06■■□□□ 1.62e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 HTRA2-206ENST00000467961 1323 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.411e-8■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 323.03■■□□□ 1.283e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-7■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 MXD3-205ENST00000503473 2279 ntTSL 533.77■■■■□ 32e-6■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 22.8
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.315e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.255e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.615e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-208ENST00000486002 876 ntTSL 225.12■■□□□ 1.615e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.915e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.675e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.025e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 236.43■■■■□ 3.422e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 234.87■■■■□ 3.172e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.842e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.422e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 521.96■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 518.07■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 219.86■□□□□ 0.774e-21■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 218.49■□□□□ 0.554e-21■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 418.43■□□□□ 0.544e-21■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.166e-9■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.073e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.623e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.436e-9■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.343e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.981e-8■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.541e-8■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.191e-8■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 240.99■■■■■ 4.157e-15■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.847e-15■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.57e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)22.05■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 246.92■■■■■ 5.11e-11■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 444.27■■■■■ 4.681e-11■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 IPO5-215ENST00000480641 543 ntTSL 438.22■■■■□ 3.712e-7■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 SLC2A4RG-205ENST00000485897 518 ntTSL 536.44■■■■□ 3.422e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 CNOT3-203ENST00000440571 1125 ntTSL 535.62■■■■□ 3.293e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 234.87■■■■□ 3.173e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.13e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 534.4■■■■□ 3.13e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 534.21■■■■□ 3.073e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 534.06■■■■□ 3.043e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 533.28■■■□□ 2.923e-6■■■■□ 22.7
GEMIN5Q8TEQ6 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 332.69■■■□□ 2.823e-6■■■■□ 22.7
Retrieved 100 of 19,123 protein–RNA pairs in 470.7 ms