Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL2P13500 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms