Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNQ92622 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms