Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC82Q8N4S0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC82Q8N4S0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms