Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSBN1Q5VWQ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms