Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TNNI3KQ59H18 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNI3KQ59H18 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms