Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEBOXQ9HB31 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms