Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP33Q8TEY7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP33Q8TEY7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms