Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNI3KQ59H18 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms