Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUNX1Q01196 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms