Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
N4BP1O75113 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
N4BP1O75113 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms