Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms