Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms