Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RRN3P1Q2M238 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RRN3P1Q2M238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms