Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM24O15164 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM24O15164 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM24O15164 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM24O15164 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms