Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT87PA6NCN2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT87PA6NCN2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms