Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRBV5-3A0A0A0MS03 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRBV5-3A0A0A0MS03 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRBV5-3A0A0A0MS03 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBV5-3A0A0A0MS03 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRBV5-3A0A0A0MS03 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRBV5-3A0A0A0MS03 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRBV5-3A0A0A0MS03 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TRBV5-3A0A0A0MS03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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