Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1AQ96P16 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms