Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRKQ15262 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
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