Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSO75390 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSO75390 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSO75390 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSO75390 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSO75390 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSO75390 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSO75390 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSO75390 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSO75390 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSO75390 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSO75390 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSO75390 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSO75390 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms