Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDB2O43679 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LDB2O43679 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LDB2O43679 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LDB2O43679 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LDB2O43679 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LDB2O43679 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LDB2O43679 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms