Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC62Q6P9F0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC62Q6P9F0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms