Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms