RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627688.1

PTENP1-AS-201, PTENP1 antisense RNA, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTENP1-AS, Length 873 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.47■■■■■ 4.87
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABCC9O60706 1549 aa41.84■■■■■ 4.29
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.29■■■■■ 4.2
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.06■■■■■ 4
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.65■■■■□ 3.94
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NACADO15069 1562 aa39.2■■■■□ 3.87
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.76■■■■□ 3.8
PTENP1-AS-201ENST00000627688 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.74■■■■□ 3.79
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.61■■■■□ 3.77
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
PTENP1-AS-201ENST00000627688 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.41■■■■□ 3.74
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.02■■■■□ 3.68
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.91■■■■□ 3.66
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.84■■■■□ 3.65
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.84■■■■□ 3.65
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.61■■■■□ 3.61
PTENP1-AS-201ENST00000627688 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SCRIBQ14160 1630 aa37.38■■■■□ 3.57
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CUX2O14529 1486 aa36.56■■■■□ 3.44
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ERCC6Q03468 1493 aa36.27■■■■□ 3.4
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NCAPD3P42695 1498 aa36.14■■■■□ 3.38
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.86■■■■□ 3.33
PTENP1-AS-201ENST00000627688 HMGXB3Q12766 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SMARCA2P51531 1590 aa35.82■■■■□ 3.32
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NESP48681 1621 aa35.68■■■■□ 3.3
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SMARCA4P51532 1647 aa35.66■■■■□ 3.3
PTENP1-AS-201ENST00000627688 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PTENP1-AS-201ENST00000627688 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.51■■■■□ 3.27
PTENP1-AS-201ENST00000627688 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TRIM41Q8WV44 630 aa35.49■■■■□ 3.27
PTENP1-AS-201ENST00000627688 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.38■■■■□ 3.25
PTENP1-AS-201ENST00000627688 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.32■■■■□ 3.24
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.31■■■■□ 3.24
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MRC2Q9UBG0 1479 aa35■■■■□ 3.19
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.98■■■■□ 3.19
PTENP1-AS-201ENST00000627688 WDR62O43379 1518 aa34.96■■■■□ 3.19
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.95■■■■□ 3.18
PTENP1-AS-201ENST00000627688 OSCARQ8IYS5 282 aa34.71■■■■□ 3.15
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.71■■■■□ 3.15
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.56■■■■□ 3.12
PTENP1-AS-201ENST00000627688 WIZO95785 1651 aa34.52■■■■□ 3.12
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CFTRP13569 1480 aa34.41■■■■□ 3.1
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.31■■■■□ 3.08
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.31■■■■□ 3.08
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.31■■■■□ 3.08
PTENP1-AS-201ENST00000627688 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PRDM2Q13029 1718 aa34.16■■■■□ 3.06
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ARHGEF11O15085 1522 aa34.11■■■■□ 3.05
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PTENP1-AS-201ENST00000627688 IFT140Q96RY7 1462 aa34.06■■■■□ 3.04
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.87■■■■□ 3.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABCC8Q09428 1581 aa33.84■■■■□ 3.01
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TOPBP1Q92547 1522 aa33.82■■■■□ 3
PTENP1-AS-201ENST00000627688 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CHD1O14646 1710 aa33.76■■■□□ 2.99
PTENP1-AS-201ENST00000627688 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ARAP1Q96P48 1450 aa33.68■■■□□ 2.98
PTENP1-AS-201ENST00000627688 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.67■■■□□ 2.98
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.64■■■□□ 2.98
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PTENP1-AS-201ENST00000627688 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FBLN2P98095 1184 aa33.51■■■□□ 2.95
PTENP1-AS-201ENST00000627688 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
PTENP1-AS-201ENST00000627688 WDR97A6NE52 1622 aa33.36■■■□□ 2.93
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.32■■■□□ 2.92
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SYNJ1O43426 1573 aa33.3■■■□□ 2.92
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SOGA1O94964 1423 aa33.26■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.23■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.23■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GRIN2BQ13224 1484 aa33.09■■■□□ 2.89
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SYNJ2O15056 1496 aa33.08■■■□□ 2.89
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.01■■■□□ 2.88
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PBRM1Q86U86 1689 aa32.94■■■□□ 2.86
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CUX1P39880 1505 aa32.9■■■□□ 2.86
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.73■■■□□ 2.83
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.71■■■□□ 2.83
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
PTENP1-AS-201ENST00000627688 GRIN2AQ12879 1464 aa32.64■■■□□ 2.82
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.62■■■□□ 2.81
PTENP1-AS-201ENST00000627688 CEP170Q5SW79 1584 aa32.62■■■□□ 2.81
PTENP1-AS-201ENST00000627688 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.6■■■□□ 2.81
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NUP160Q12769 1436 aa32.58■■■□□ 2.81
PTENP1-AS-201ENST00000627688 SHROOM2Q13796 1616 aa32.56■■■□□ 2.8
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ADAMTS12P58397 1594 aa32.53■■■□□ 2.8
PTENP1-AS-201ENST00000627688 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.43■■■□□ 2.78
PTENP1-AS-201ENST00000627688 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.78
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.32■■■□□ 2.76
PTENP1-AS-201ENST00000627688 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PTENP1-AS-201ENST00000627688 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.29■■■□□ 2.76
PTENP1-AS-201ENST00000627688 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.27■■■□□ 2.76
PTENP1-AS-201ENST00000627688 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms