Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTP4A2Q12974 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A2Q12974 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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