Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH6P55285 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH6P55285 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH6P55285 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH6P55285 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH6P55285 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH6P55285 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms