Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS1P54277 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS1P54277 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS1P54277 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMS1P54277 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PMS1P54277 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PMS1P54277 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS1P54277 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMS1P54277 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS1P54277 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS1P54277 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS1P54277 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS1P54277 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMS1P54277 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS1P54277 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS1P54277 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms