Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLK3Q9C098 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms