Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS25Q9BRG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms