Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
EXT1Q16394 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXT1Q16394 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms