Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRKQ15262 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRKQ15262 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
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