Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
EEA1Q15075 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
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