Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PABPC1P11940 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC1P11940 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms