Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRPF40AO75400 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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