Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms