Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN7Q9Y6W3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN7Q9Y6W3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN7Q9Y6W3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN7Q9Y6W3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN7Q9Y6W3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN7Q9Y6W3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN7Q9Y6W3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms