Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3AQ9Y6K1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3AQ9Y6K1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3AQ9Y6K1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3AQ9Y6K1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3AQ9Y6K1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3AQ9Y6K1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DNMT3AQ9Y6K1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT3AQ9Y6K1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT3AQ9Y6K1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3AQ9Y6K1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3AQ9Y6K1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms