Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMACHCQ9Y4U1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMACHCQ9Y4U1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMACHCQ9Y4U1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMACHCQ9Y4U1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMACHCQ9Y4U1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMACHCQ9Y4U1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMACHCQ9Y4U1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms