Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC2Q9Y235 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC2Q9Y235 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC2Q9Y235 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC2Q9Y235 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC2Q9Y235 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOBEC2Q9Y235 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOBEC2Q9Y235 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOBEC2Q9Y235 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms