Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERG28Q9UKR5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERG28Q9UKR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERG28Q9UKR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERG28Q9UKR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERG28Q9UKR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms