Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00527Q9UJ94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00527Q9UJ94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00527Q9UJ94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00527Q9UJ94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00527Q9UJ94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00527Q9UJ94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms