Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF2Q9NX18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHAF2Q9NX18 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAF2Q9NX18 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF2Q9NX18 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHAF2Q9NX18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHAF2Q9NX18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms