Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00846Q9NV44 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00846Q9NV44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00846Q9NV44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00846Q9NV44 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00846Q9NV44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms