Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A2Q9NQ11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A2Q9NQ11 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A2Q9NQ11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP13A2Q9NQ11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP13A2Q9NQ11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP13A2Q9NQ11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A2Q9NQ11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A2Q9NQ11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A2Q9NQ11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1618.3 ms