Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3K2

GHITM, Growth hormone-inducible transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHITMQ9H3K2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GHITMQ9H3K2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GHITMQ9H3K2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHITMQ9H3K2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GHITMQ9H3K2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GHITMQ9H3K2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GHITMQ9H3K2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GHITMQ9H3K2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms