Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX6-2Q9C056 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX6-2Q9C056 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX6-2Q9C056 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX6-2Q9C056 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX6-2Q9C056 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX6-2Q9C056 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms