Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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KRTAP9-2Q9BYQ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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KRTAP9-2Q9BYQ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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KRTAP9-2Q9BYQ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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KRTAP9-2Q9BYQ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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